Theo Quyết định số 1913/QĐ-BTC ngày 30/5/2025 của Bộ Tài chính về việc công bố thủ tục hành chính mới ban hành, được sửa đổi, bổ sung, bị bãi bỏ trong lĩnh vực quản lý Thuế, Hải quan thuộc phạm vi chức năng quản lý của Bộ Tài chính
Trong đó có Thủ tục hành chính mới đó là: Xử lý chứng từ điện tử đã lập sai
Theo đó thì:
Đối với trường hợp chứng từ điện tử đã lập sai thì tổ chức, cá nhân khấu trừ thuế thực hiện xử lý chứng từ điện tử theo trình tự như sau:
Bước 1: Trường hợp chứng từ điện tử đã lập đã gửi cơ quan thuế bị sai thì xử lý như sau:
Trường hợp có sai về tên, địa chỉ của tổ chức, cá nhân bị khấu trừ nhưng không sai mã số thuế, số định danh cá nhân, giấy tờ tùy thân hoặc số hộ chiếu và các nội dung khác không sai: Tổ chức, cá nhân trả thu nhập thông báo cho người bị khấu trừ thuế về việc chứng từ khấu trừ thuế bị sai và không phải lập lại chứng từ mới. Tổ chức trả thu nhập thực hiện thông báo với cơ quan thuế về chứng từ điện tử đã lập sai theo Mẫu số 04/SS-CTĐT Phụ lục IA ban hành kèm theo Nghị định số 70/2025/NĐ-CP ngày 20/3/2025 của Chính phủ.
Bước 2: Hệ thống thông tin giải quyết thủ tục hành chính của ngành thuế tự động tiếp nhận thông báo về việc tiếp nhận Mẫu 04/SS-CTĐT Phụ lục IB ban hành kèm theo Nghị định số 70/2025/NĐ-CP, qua Hệ thống thông tin giải quyết thủ tục hành chính của ngành thuế hoặc qua tổ chức cung cấp dịch vụ hóa đơn điện tử. 
Bước 3: Cơ quan Thuế tiếp nhận dữ liệu điện tử.
- Cách thức thực hiện: Bằng phương thức điện tử qua Hệ thống thông tin giải quyết thủ tục hành chính của ngành thuế hoặc qua tổ chức cung cấp dịch vụ hoá đơn điện tử.
- Thành phần hồ sơ, gồm: Mẫu 04/SS-CTĐT Thông báo chứng từ điện tử đã lập sai;
- Số lượng hồ sơ: 01 (bộ).
- Thời hạn giải quyết: Trong thời hạn 01 ngày làm việc;